Základ plastické výzdoby interiéru muzea položil Antonín Popp svými dvaatřiceti portrétními medailony na pozadí vavřínových a dubových ratolestí, zpodobujícími panovníky na českém trůně. Dalším, přirozeně monumentálnějším, sochařským souborem je sedmnáct bust osobností, které se v průběhu existence muzea zasloužili svou odbornou či organizační prací a velkorysými dary a odkazy o vznik muzea. Hlavní obsah monumentálního Pantheonu pak tvoří velký sochařský soubor podobizen zasloužilých vědců, literátů, hudebníků, výtvarných umělců a architektů.
-
Karel Jaromír Erben - busta v Pantheonu
-
Karel Čapek - busta v Pantheonu
-
Kašpar hrabě Šternberk - socha v Pantheonu
-
Kněžna Libuše - socha ve vestibulu
-
Mikoláš Aleš - busta v Pantheonu
-
Přemysl Oráč - socha ve vestibulu
-
Přemysl Otakar II. - socha ve vestibulu
-
Svatopluk Čech - busta v Pantheonu
-
Svatý Václav ve vestibulu
-
Tomáš Garrigue Masaryk - socha v Pantheonu
-
Václav Hollar - busta v Pantheonu